Con sede presso l'isola A/6 del Centro Direzionale di Napoli è organizzato in Servizi, secondo il seguente organigramma:

• Servizio 01 Economico Finanziario; Contenzioso; Liquidazioni finanziamenti FSE/POR AGC 17

• Servizio 02 Gestione del Sistema Formazione; Coordinamento FSE/POR; Decentramento; Affari generali e Personale; Supporto al Coordinamento dell'Area 17

• Servizio 03 Ispettivo; Controllo di 1° Livello Misure FSE/POR

• Servizio 04 Progetti Integrati e Azioni Innovative